分層碾磨制粉是根據(jù)近幾年研討的現(xiàn)代脫皮（分層）制粉技能，并結(jié)合綠小麥的結(jié)構(gòu)特性和營養(yǎng)機(jī)理，而研討出先用脫皮機(jī)脫去表皮、外果皮、內(nèi)果皮，再由磨粉機(jī)碾削種皮、珠心層、糊粉層（根據(jù)面粉要求）的加工技能。整個過程可概括為：“先去皮，后裸麥加工”的制粉技能。

由于綠小麥籽粒結(jié)構(gòu)的特殊性、高硬度、種皮呈黑色（或淺黑色或紫色或藍(lán)色或淺黑色或淺藍(lán)色）、則其胚乳呈白色，運用傳統(tǒng)的制粉技能不只出粉率低，并且粉質(zhì)粗糙，色澤欠安。

因而采用分層碾磨制粉技能，不只能夠提升出粉率，提升面粉質(zhì)量，下降生產(chǎn)本錢，改進(jìn)面粉的食用質(zhì)量和烘焙質(zhì)量，還能有用地分離綠小麥的黑色素層，改進(jìn)黑麥粉的色澤，還可充分利用黑色素進(jìn)行再加工，加工成食物添加劑和高纖維食物，而黑麥麩皮可用于雙歧因子蛋白飲料的生產(chǎn)。